PubMed Central

Vikipedi, özgür ansiklopedi
Gezintiye atla Aramaya atla
PubMed Central
ÜreticiAmerika Birleşik Devletleri Ulusal Tıp Kütüphanesi (Amerika Birleşik Devletleri)
Tarih2000 sunmak
Giriş
MaliyetBedava
Kapsam
Disiplinlerİlaç
Kayıt derinliğiDizin, özet ve tam metin
Kapsamı biçimlendirDergi makaleleri
Bağlantılar
İnternet sitesihttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
Başlık listelerihttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/journals/

PubMed Central ( PMC ), biyomedikal ve yaşam bilimleri dergilerinde yayınlanan açık erişimli tam metin bilimsel makaleleri arşivleyen ücretsiz bir dijital depodur . Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI) tarafından geliştirilen başlıca araştırma veri tabanlarından biri olan PubMed Central, bir belge havuzundan daha fazlasıdır. PMC'ye yapılan gönderimler, her makale için XML yapılandırılmış verilerini zenginleştiren gelişmiş meta veriler , tıbbi ontoloji ve benzersiz tanımlayıcılar için indekslenir ve biçimlendirilir . [1] PMC içindeki içerik, diğer NCBI veritabanlarına bağlanabilir ve şu yolla erişilebilir:Entrez arama ve erişim sistemleri, halkın biyomedikal bilgilerini keşfetme, okuma ve geliştirme becerisini daha da geliştirir. [2]

PubMed Central ayrıdır PubMed . [3] PubMed Central, bir web tarayıcısı aracılığıyla herhangi bir yerden herkes tarafından erişilebilen (yeniden kullanım için değişen hükümlerle) tam makalelerin ücretsiz bir dijital arşividir. Tersine, PubMed biyomedikal alıntıların ve özetlerin aranabilir bir veritabanı olmasına rağmen, tam metin makale başka bir yerde bulunur (basılı veya çevrimiçi, ücretsiz veya abone ödeme duvarının arkasında ).

Aralık 2018 itibarıyla , PMC arşivi 5.2 milyondan fazla makale içeriyordu, [4] yayıncılardan veya yazarlardan gelen katkılar, makalelerini NIH Genel Erişim Politikası uyarınca depoya saklıyordu . Daha önceki veriler, Ocak 2013'ten Ocak 2014'e kadar yazar tarafından başlatılan mevduatların 12 aylık bir dönemde 103.000 makaleyi aştığını gösteriyor. [5] PMC, yayınlanmış içeriklerini PMC havuzuna depolamak için bir miktar kapasiteye sahip yaklaşık 4.000 dergi tanımlar. [6]Bazı yayıncılar, dergiye bağlı olarak birkaç aydan birkaç yıla kadar değişen, "ambargo süresi" olarak adlandırılan, PubMed Central'daki makalelerinin yayınlanmasını belirli bir süre için ertelemektedir. (Altı ila on iki aylık ambargolar en yaygın olanlardır.) PubMed Central, birçok yayıncının katkıda bulunan anlaşmaları tarafından hala yasaklanmış olan "üçüncü bir tarafın sistematik dış dağıtımının" [7] önemli bir örneğidir .

Benimseme [ düzenle ]

Şubat 2000'de başlatılan, NIH Kamusal Erişim Politikası , Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH) tarafından finanse edilen tüm araştırmaları herkesin ücretsiz olarak erişebilmesi için tasarlandığından ve buna ek olarak, birçok yayıncı NIH ile işbirliği içinde çalıştığından, hızlı bir şekilde büyümüştür. çalışmalarına ücretsiz erişim sağlamak. 2007'nin sonlarında, 2008 Konsolide Ödenekler Yasası (HR 2764) yasa ile imzalandı ve NIH'nin politikalarını değiştirmesini ve NIH tarafından finanse edilen NIH tarafından finanse edilen bulguların eksiksiz elektronik kopyalarının PubMed Central'a dahil edilmesini gerektiren bir hüküm içeriyordu. Araştırma. Bu makalelerin yayınlandıktan sonraki 12 ay içinde eklenmesi gerekmektedir. ABD hükümeti ilk kez bir ajansın açık erişim sağlamasını talep ettiNIH'nin araştırmacılardan araştırmalarını gönüllü olarak PubMed Central'a eklemelerini istediği 2005 politikasının bir evrimidir. [8]

PubMed Central sisteminin Birleşik Krallık versiyonu olan UK PubMed Central (UKPMC) , dokuz kişilik bir İngiliz araştırma fon sağlayıcısı grubunun parçası olarak Wellcome Trust ve British Library tarafından geliştirilmiştir . Bu sistem Ocak 2007'de devreye girdi. 1 Kasım 2012'de Europe PubMed Central oldu . PubMed Central International ağının Kanadalı üyesi PubMed Central Canada , Ekim 2009'da açıldı.

Ulusal Tıp Kütüphanesi "NLM Dergi Yayıncılık Etiket Seti" dergi makale biçimlendirme dili serbestçe kullanılabilir. [9] The Association of Learned and Professional Society Publishers , "hem kitaplar hem de dergiler için bilimsel içerik hazırlama standardı haline gelme olasılığı yüksek" yorumunu yaptı. [10] Kitaplar için ilgili bir DTD mevcuttur. [11] Kongre Kütüphanesi ve British Library NLM DTD desteği açıkladı. [12] Dergi servis sağlayıcıları arasında da popüler olmuştur. [13]

NIH dışındaki birçok ajans için halka açık erişim planlarının yayınlanmasıyla, PMC daha geniş bir makale yelpazesi için depo olma sürecindedir. [14] Bu, "PubSpace" markalı arayüze sahip NASA içeriğini içerir. [15] [16]

Teknoloji [ düzenle ]

Makaleler, yayıncılar tarafından çeşitli makale DTD'leri kullanılarak XML veya SGML biçiminde PubMed Central'a gönderilir . Daha eski ve daha büyük yayıncıların kendi kurum içi DTD'leri olabilir, ancak birçok yayıncı NLM Journal Publishing DTD'yi kullanır (yukarıya bakın).

Alınan makaleler XSLT aracılığıyla çok benzer NLM Arşivleme ve Değişim DTD'sine dönüştürülür. Bu işlem, düzeltme için yayıncıya geri bildirilen hataları ortaya çıkarabilir. Grafikler ayrıca standart formatlara ve boyutlara dönüştürülür. Orijinal ve dönüştürülmüş formlar arşivlenir. Dönüştürülen form, grafik, multimedya veya diğer ilişkili veriler için ilişkili dosyalarla birlikte ilişkisel bir veritabanına taşınır. Birçok yayıncı , makalelerinin PDF'ini de sağlar ve bunlar değiştirilmeden kullanıma sunulur. [17]

Bibliyografik alıntılar ayrıştırılır ve otomatik olarak PubMed'deki ilgili özetlere, PubMed Central'daki makalelere ve yayıncıların Web sitelerindeki kaynaklara bağlanır. PubMed bağlantıları ayrıca PubMed Central'a da götürür. Bu kaynaklardan birinde henüz bulunmayan dergiler veya belirli makaleler gibi çözümlenemeyen referanslar veritabanında izlenir ve kaynaklar kullanılabilir olduğunda otomatik olarak "yayınlanır".

Şirket içi bir indeksleme sistemi, arama yeteneği sağlar ve jenerik ve tescilli ilaç isimleri ve organizmalar, hastalıklar ve anatomik parçalar için alternatif isimler gibi biyolojik ve tıbbi terminolojinin farkındadır .

Bir kullanıcı bir dergi sayısına eriştiğinde, o sayı için tüm makaleler, mektuplar, başyazılar vb. Alınarak otomatik olarak bir içindekiler tablosu oluşturulur. Bir makale gibi gerçek bir öğeye ulaşıldığında, PubMed Central NLM biçimlendirmesini teslim için HTML'ye dönüştürür ve ilgili veri nesnelerine bağlantılar sağlar. Bu mümkündür çünkü gelen verilerin çeşitliliği ilk olarak standart DTD'lere ve grafik formatlarına dönüştürülmüştür.

Ayrı bir gönderi akışında, NIH tarafından finanse edilen yazarlar, makaleleri NIH El Yazması Gönderimini (NIHMS) kullanarak PubMed Central'a yatırabilir. Bu şekilde gönderilen makaleler, NLM DTD'ye dönüştürülmek için tipik olarak XML biçimlendirmesinden geçer.

Alım [ düzenle ]

Bilimsel yayıncılık topluluğu arasında PubMed Central'a tepkiler, bazılarının gerçek bir coşkusu [18] , diğerlerinin ihtiyatlı ilgisi arasında değişir . [19]

PMC, biyomedikal bilginin keşfini ve yayılmasını artırma kabiliyetinde açık erişim yayıncıları için hoş bir ortak olsa da, bu aynı gerçek, başkalarının trafiğin yayınlanmış sürümünden , daha az okuyucunun ekonomik sonuçlarından sapması konusunda endişelenmesine neden olur. öğrenilmiş toplumlar içinde bir akademisyenler topluluğunu sürdürme üzerindeki etkisi olarak. [20] [21] Bir 2013 analizi, yayınlanan makalelerin halka açık depolarının "önemli sayıda okuyucuyu dergi web sitelerinden uzaklaştırmaktan" sorumlu olduğuna ve "PMC'nin etkisinin zamanla arttığına" dair güçlü kanıtlar buldu. [22]

Kütüphaneler, üniversiteler, açık erişim destekçileri, tüketici sağlığı savunucu grupları ve hasta hakları kuruluşları PubMed Central'ı alkışladılar ve vergi mükelleflerinin desteğinin sonucu olan araştırma yayınlarını özgürce paylaşmak için diğer federal finansman kurumları tarafından geliştirilen benzer kamu erişim havuzlarını görmeyi umuyorlar. . [23]

Antelman'ın açık erişimli yayıncılık çalışması, felsefe, siyaset bilimi, elektrik ve elektronik mühendisliği ve matematikte açık erişimli makalelerin daha büyük bir araştırma etkisine sahip olduğunu buldu. [24] Rastgele bir çalışma, yayınlandıktan bir yıl sonra abonelik erişimine göre atıf avantajı olmaksızın, açık erişimli makalelerin içerik indirmelerinde bir artış buldu. [25]

NIH politikası ve açık erişim arşivi çalışması, diğer federal kurumlarda da harekete geçen bir 2013 başkanlık direktifine ilham verdi .

Mart 2020'de PubMed Central, koronavirüs ile ilgili yayınların tam metni için para yatırma işlemlerini hızlandırdı . NLM, bunu, Beyaz Saray Bilim ve Teknoloji Politikası Ofisi'nin ve uluslararası bilim adamlarının talebi üzerine, bilim adamları, sağlık hizmeti sağlayıcıları, veri madenciliği yenilikçileri , AI sağlık araştırmacıları ve genel halk için erişimi iyileştirmek için yaptı . [26]

PMCID [ düzenle ]

Ayrıca PMC referans numarası olarak bilinen Bulunamayan PMCID (PubMed merkezi belirleyici), a, bibliyografik tanımlayıcı çok gibi, PubMed merkezi veritabanı için Sayfalar bibliyografik tanımlayıcıdır PubMed veritabanı. Ancak iki tanımlayıcı farklıdır. "PMC" ve ardından yedi sayı dizisinden oluşur . Biçim: [27]

  • PMCID: PMC1852221

NIH ödülleri için başvuran yazarlar, başvurularına PMCID'yi dahil etmelidir.

Ayrıca bkz. [ Düzenle ]

  • Avrupa PubMed Central
  • JATS (teknoloji)
  • MEDLINE , yaşam bilimleri ve biyomedikal bilgiler için uluslararası bir literatür veritabanı
  • PMID (PubMed Tanımlayıcı)
  • PubMed Orta Kanada
  • Redalyc (Latin Amerika'ya odaklanan benzer bir proje)
  • SciELO (benzer hizmet)

Referanslar [ düzenle ]

  1. ^ Beck J (2010). "Alandan Rapor: PubMed Central, XML tabanlı bir Yaşam Bilimleri Dergisi Makaleleri Arşivi". Uzun Süreli XML Uluslararası Sempozyumu Bildirileri: XML'nin Uzun Süreli Korunmasında Sorunlar . 6 . doi : 10.4242 / BalisageVol6.Beck01 . ISBN 978-1-935958-02-4.
  2. ^ Maloney C, Sequeira E, Kelly C, Orris R, Beck J (5 Aralık 2013). PubMed Central . Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (ABD).
  3. ^ "MEDLINE, PubMed ve PMC (PubMed Central): Nasıl farklılar?" . www.nlm.nih.gov . 9 Eylül 2019.
  4. ^ "Varsayılan Olarak Açıklık", Inside Higher Ed , 16 Ocak 2017.
  5. ^ "NIHMS İstatistikleri" . nihms.nih.gov .
  6. ^ "Ana Sayfa - PMC - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov .
  7. ^ Ouerfelli N. "Yazar hakları: neyle ilgili" (PDF) .
  8. ^ "NIH araştırmalarına halkın erişimi kanunlaştırıldı" . Bilim Kodeksi . 2007. 4 Mart 2016 tarihinde orjinalinden arşivlendi . Erişim tarihi: 6 Kasım 2013 .
  9. ^ "Dergi Yayınlama Etiket Seti" . Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi . Erişim tarihi: 6 Kasım 2013 .
  10. ^ French D (4 Ağustos 2006). "ALPSP Teknoloji Güncellemesi: Standart Bir XML Belge Biçimi: NLM DTD'nin benimsenmesi durumu" . ALPSP . Erişim tarihi: 6 Kasım 2013 .
  11. ^ "NCBI Kitap Etiket Seti" . dtd.nlm.nih.gov .
  12. ^ "Kongre Kütüphanesinden Haberler" . Kongre Kütüphanesi . 19 Nisan 2006 . Erişim tarihi: 6 Kasım 2013 .
  13. ^ "Inera Inc. - NLM DTD Kaynakları" . 19 Şubat 2013. 2013-02-19 tarihinde orjinalinden arşivlendi .
  14. ^ "ABD Federal Ajanslarının Kamu Erişim Planları" . cendi.gov .
  15. ^ Kovo Y (22 Temmuz 2016). "NASA Tarafından Finanse Edilen Araştırmaların Sonuçlarına Kamu Erişimi" . nasa.gov .
  16. ^ "PMC'de NASA" . Preview.ncbi.nlm.nih.gov .
  17. ^ NLM Journal Archiving and Interchange Tag Suite , National Center for Biotechnical Information, National Library of Medicine
  18. ^ "PLOS Açık Erişim Üzerine Eylem Kongresi'ni Alkışladı" . Arşivlenmiş orijinal 2016-05-07 tarihinde . Erişim tarihi: 2014-02-07 .
  19. ^ "Bilim ve Teknoloji Ofisine ACS Gönderimi, Federal Olarak Finanse Edilen Araştırmalardan Kaynaklanan Hakemli Bilimsel Yayınlara Kamu Erişimi Hakkında Bilgi Talebi" (PDF) . Bilim ve Teknoloji Politikası Ofisi . Erişim tarihi: 2014-02-07 - National Archives aracılığıyla .
  20. ^ Davis PM (Ekim 2012). "Bilimsel makalelerin kamuya açıklanmasının okuyucu üzerindeki etkisi". Fizyolog . 55 (5): 161, 163–5. PMID 23155924 . 
  21. ^ Davis PM (Temmuz 2013). "PubMed Central'dan biyomedikal makalelerin halka açık erişilebilirliği dergi okuyucu sayısını azaltır - geriye dönük kohort analizi" . FASEB Dergisi . 27 (7): 2536–41. doi : 10.1096 / fj.13-229922 . PMC 3688741 . PMID 23554455 .  
  22. ^ Davis PM (Temmuz 2013). "PubMed Central'dan biyomedikal makalelerin halka açık erişilebilirliği dergi okuyucu sayısını azaltır - geriye dönük kohort analizi" . FASEB Dergisi . 27 (7): 2536–41. doi : 10.1096 / fj.13-229922 . PMC 3688741 . PMID 23554455 .  
  23. ^ "Otizm Konuşuyor Ailelere Temel Araştırma Bulgularına Kolay ve Ücretsiz Erişim Sağlamak İçin Yeni Bir Politika Duyurdu - Basın Bülteni - Otizm Konuşuyor" . www.autismspeaks.org . 25 Temmuz 2012.
  24. ^ Antelman, Kristin (2004). "Açık Erişim Makalelerinin Daha Büyük Araştırma Etkisi Var mı?" . Kolej ve Araştırma Kitaplıkları . 65 (5): 372–382. doi : 10.5860 / crl.65.5.372 .Stemper J, Williams K (2006) tarafından özetlenmiştir . "Bilimsel iletişim: Krizi fırsata çevirmek" . Kolej ve Araştırma Kitaplıkları Haberleri . 67 (11): 692-696. doi : 10.5860 / crln.67.11.7720 .
  25. ^ Davis PM, Lewenstein BV, Simon DH, Booth JG, Connolly MJ (Temmuz 2008). "Açık erişim yayınlama, makale indirmeleri ve alıntılar: randomize kontrollü deneme" . BMJ . 337 : a568. doi : 10.1136 / bmj.a568 . PMC 2492576 . PMID 18669565 .  
  26. ^ "Ulusal Tıp Kütüphanesi, PubMed Central aracılığıyla koronavirüs literatürüne erişimi genişletiyor" . Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH) . 2020-03-25 . Erişim tarihi: 2020-03-31 . Bu girişimi desteklemek için NLM, koronavirüs araştırmalarının kolayca erişilebilir olmasını sağlayacak daha fazla esneklik sağlamak için makaleleri PMC'ye yerleştirmeye yönelik standart prosedürlerini uyarlıyor.
  27. ^ "Alıntılara PMCID'yi Dahil Et | publicaccess.nih.gov" . publicaccess.nih.gov . Erişim tarihi: 2017-07-01 .

Dış bağlantılar [ düzenle ]

  • Resmi internet sitesi
  • Ulusal Sağlık Başvuru Sistemi Enstitüleri (NIHMS)
  • NIH Kamu Erişim Politikası